من مهام هذا القسم متابعة وتدقيق كافة العمليات الماليه التي ينظمها قسم الحسابات والتاكد من استيفائها للمتطلبات القانونيه والتعليمات المالية النافذه كذلك اجراء عمليات التدقيق والرقابه الداخليه على كافة الانشطه الاخرى ذات الاثر المالي وتدقيق اعمال المخازن ومتابعة حركة الموجودات